Научно-преподавателската дейност в СБАЛХЗ се отличава с изключително високо качество и професионализъм, което се потвърждава от конкретните резултати като брой подготвени специалисти, значителната научна дейност, участие в престижни научни форуми и съвместни изследвания, включително и на международно ниво. Общо, от състава на предхождащите СБАЛХЗ структури са защитени 13 докторски дисертации за придобиване на научната степен "доктор на медицинските науки" и над 70 дисертации за придобиване на образователната и научна степен "Доктор".
Националното външно оценяване на качеството на лечебното заведение е циклично и се осъществява от Министерството на образованието (МОН), Министерството на здравеопазването (МЗ) и от Националната агенция по оценяване и акредитация (НАОА).